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Webapp de exploraçao de dados de analises de splicing alternativo

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Donandrade/GeneAPP

 
 

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GeneAPP - explorador de resultados de analises de Alternative Splicing (Vite, Vue3, Tailwind)

Esse repositorio contem o codigo do aplicativo GeneAPP https://gene.mikeias.net/ O GeneAPP foi desenvolvido para auxiliar bioinformatas a explorar resultados das analises de AS em especial output dos softwares rMATS e 3DRNAseq.

Em resumo o aplicativo:

  • Disponibiliza um script para gerar o dataset pelo no Colab
  • Junta os outputs para os genes
  • Gera graficos

Recursos usados neste projeto:

  • Vite 3 (Pseudo backend)
  • Vue 3 (framework JS)
  • Tailwind CSS 3 (framework css)
  • Heroicons (icones)
  • [Node.js] (gerenciador de pacotes)
  • [D3] (graficos svg)
  • [Firebase] (hospedagem)
  • [VS CODE] (IDE)
  • [Colab] ()

Getting Started

npm i
npm run dev
npm run build
npm run serve

Deploy to Netlify

Desenvolvido por mikeias.net para o Capitulo III da tese de Doutorado submetida ao PPG em Bioinformatica do ICB/UFMG

About

Webapp de exploraçao de dados de analises de splicing alternativo

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No releases published

Packages

No packages published

Languages

  • Vue 36.0%
  • TypeScript 35.9%
  • Shell 26.2%
  • Jupyter Notebook 0.7%
  • JavaScript 0.6%
  • Dockerfile 0.4%
  • Other 0.2%