CardioSpike

Итоговый проект курса "Машинное обучение в бизнесе"

Авторы: Александр Клянчин, Илья Галухин

Стек:

• ML: catboost, sklearn, pandas, numpy.
• API: flask.
• Данные: Цифровой Прорыв, Хакатон "Медицина, здравоохраниение, наука", кейс "Разработка детектора ковидных аномалий в ритме сердца" https://leadersofdigital.ru/event/63008/case/706486#cases

Задача: Разработка детектора COVID-19 аномалий в ритме сердца.

Разработанный веб-сервис: http://paydocs.ru

Сервис CardioSpike по предсказанию COVID-19 аномалий в ритме сердца установлен на стандартный хостинг в режиме Virtual Private Server (https://en.wikipedia.org/wiki/Virtual_private_server). В данной конфигурации архитектура не подразумевает разделения на компоненты Front и API Backend. Однако допустимо например запустить 2 копии сервера, чтобы 1 сервер был в роли Front, а второй в роли API Backend.

• Адрес сервера: server5.hosting.reg.ru
• IP адрес: 31.31.198.106
• Внешний доступ через домен http://paydocs.ru
• Основной тестируемый API http://paydocs.ru/predict [POST]

Формат передаваемых данных:

{'id': [ id0, id1, ... ], 'x': [x0, x1, ...]}, где

• id - идентификатор пациента
• x - измерения пульса R-R

Преобразования данных:

• Сериализация в строку JSON - json.dumps
• Кодирование в utf-8 - str.encode('utf-8')

Основные компоненты системы:

• task09.ipynb - исходное задание на курсовую работу
• EDA_and_learning_model/CardioSpike2.ipynb - EDA и создание модели.
• requirements_prod.txt - необходимые компоненты для установки на сервер
• app/run_server.py - запуск сервера на основе Flask
• pipeline.py - пайплайн предобработки и постобработки данных.
• app/model/dill_clf_model.dill - реализованная модель
• app/data - примеры профилей пациентов
  • app/data/patient_1_non_anomaly.csv - предварительно отрицательный диагноз
  • app/data/patient_2_anomaly.csv - предварительно положительный диагноз
  • app/data/patient_3_anomaly.csv - предварительно положительный диагноз
• test_api/test_api.ipynb - тестирование внешнего API
  • test_api/data - данные для тестирования

Авторы:

• Галухин Илья @i_galukhin Lutiyroker@yandex.ru
• Клянчин Александр @AlexKChin alex.kchin@gmail.com +7(916)587-0140