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xiaolongliang/Useful-script

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对不同列数的行进行转置

将test.txt中的每一行转置成对应的一列

python Row2Col.py

文件匹配

  • kog_1为每个KOG富集条目所包含的基因
  • kog_matches.m8中第二列为基因 要求:将kog_1中每个KOG条目在kog_matches.m8中所包含的基因找出来
python 02.shipx.py > 20220512_results.txt

Go analysis 画图

Rscript 03.GoEnrich.R

FindCloserTSSinCNE

  • 11.tss.bed TSS位点文件
  • 10.20bp.bed CNE文件
  • 找出CNE区域左右两侧离得最近的TSS位点(同一条染色体上)
python FindCloserTSSinCNE.py > results.txt

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